DNA聚合酶I与脱氧核苷三磷酸和焦磷酸络合的Klenow片段的晶体结构。
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Beese LS, Friedman JM, Steitz TA
DNA聚合酶I与脱氧核苷三磷酸和焦磷酸络合的Klenow片段的晶体结构。
生物化学。1993 Dec 28;32(51):14095-101。
- PubMed ID
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8260491 (PubMed视图］
- 摘要
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来自大肠杆菌的DNA聚合酶I的Klenow片段(KF)与脱氧核苷三磷酸(dNTP)或焦磷酸盐(PPi)复合物的晶体结构通过x射线晶体学测定到3.9-A分辨率，显示这些分子结合在聚合酶结构域的裂缝内，并被先前涉及dNTP结合的残基包围。dNTP结合在o型螺旋附近[olis, D. L.， Brick, P.， Hamlin, R.， Xuong, N. G.， & Steitz, T. A. (1985a)自然313,762-766]，其三磷酸部分由三个正电荷残基Arg 754, Arg 682和Lys 758以及His 734和Gln 708锚定。在晶体中观察到的dNTP结合位点与包括交联在内的化学修饰结果一致，也靠近许多突变影响催化的氨基酸残基[Polesky, a.h .， Steitz, t.a .， Grindley, n.d.f .， & Joyce, c.m . (1990) J. Biol。化学265,14579-14591;Polesky, a.h.， Dahlberg, m.e.， Benkovic, s.j.， Grindley, n.d.f.， & Joyce, c.m.(1992)。化学267,8417-8428]。然而，我们得出结论，dNTP的至少dNMP部分在二元配合物中的位置不太可能与其与引物模板DNA的催化相关配合物中的位置相同。