Modification-specific等离子体膜蛋白的蛋白质组学:识别和表征glycosylphosphatidylinositol-anchored蛋白质释放在磷脂酶D治疗。
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福斯特Elortza F,穆罕默德,Bunkenborg J, LJ, Nuhse TS,他U,派克SC,詹森
Modification-specific等离子体膜蛋白的蛋白质组学:识别和表征glycosylphosphatidylinositol-anchored蛋白质释放在磷脂酶D治疗。
蛋白质组研究》2006年4月;5 (4):935 - 43。
- PubMed ID
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16602701 (在PubMed]
- 文摘
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等离子体膜蛋白显示通过不同的机制,包括锚定在细胞外通过glycosylphosphatidylinositol传单(GPI)分子。GPI-anchored膜蛋白(GPI-APs)是一个功能和结构多样的蛋白质家族,和它们的重要性是公认的候选细胞表面与潜在生物标志物分子在分子医学诊断和治疗应用。GPI-APs也吸引了兴趣在根发展植物生物技术,因为他们的作用和细胞重构。使用一个shave-and-conquer概念,我们表明,磷脂酶D(骑士)治疗人类和植物质膜分数导致GPI-anchored蛋白质的释放被识别和特征是毛细管液相色谱串联质谱分析。与磷脂酶C相比,骑士酶不受结构影响GPI一半的异质性,使骑士一般有用试剂GPI-anchored蛋白质的蛋白质组学研究在各种细胞、组织和生物体。共有11人GPI-APs 35拟南芥GPI-APs,代表一个重要除了GPI-APs实验发现在两个物种的数量。计算GPI-AP序列特征的分析工具进行调查确认GPI-APs,这些表明有一些差异在GPI-APs分类的效率和omega-sites的具体任务。这项研究强调了效率的综合蛋白质组学方法,结合实验和计算方法提供选择性,特异性和灵敏度要求描述你修改后的膜蛋白。