完整的基因组序列和比较基因组学弗氏志贺菌血清型2 2457 t。

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魏J,戈德堡MB, Burland V,文卡特斯MM,邓W,弗尔涅克,梅休GF,冷藏室G第三,玫瑰DJ,亲爱的,茂B,佩纳NT,佩恩SM, Runyen-Janecky LJ,周年代,施瓦茨,布拉特纳FR

完整的基因组序列和比较基因组学弗氏志贺菌血清型2 2457 t。

71年5月,感染Immun。2003 (5): 2775 - 86。

PubMed ID

12704152 (在PubMed

]

文摘

我们确定的完整基因组序列2弗氏志贺菌血清型菌株2457 t(4599354个基点)。志贺氏杆菌物种造成>从痢疾和腹泻每年100万人死亡,一种生活方式,明显不同于细菌密切相关,包括大肠杆菌。基因组展品的骨干和岛屿镶嵌结构大肠杆菌病原体,虽然少了很多横向转移DNA和缺少357个基因在大肠杆菌。的应变是独特的在其大补插入序列,与几个基因组重组由插入序列,12个神秘的噬菌体原,372假基因和195 s flexneri-specific基因。2457 t基因也与最近测序s flexneri 2株,301年。我们的数据是一致的志贺氏杆菌从大肠杆菌系统无法区分。美国flexneri-specific区域包含许多基因可能编码蛋白质毒性的作用。这些分析将揭示这个致病生物的遗传基础方面的独特生活方式尚未解释道。

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多肽

的名字	UniProt ID
50年代L10核糖体蛋白质	P0A7J6	细节
UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	P0A751	细节
2-C-methyl-D-erythritol 4-cyclodiphosphate合成酶	P62619	细节
ADP-ribose焦磷酸酶	P83844	细节
Transaldolase B	P0A872	细节
脂肪酸代谢调节蛋白质	P0A8V9	细节
2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate醛缩酶	P0A716	细节
细胞分裂的蛋白质安然	Q83QN9	细节
外膜脂蛋白LolB	P61322	细节
S-adenosylmethionine合酶	P0A820	细节
天冬氨酸1-decarboxylase	P0A793	细节
4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol激酶	Q83LD8	细节
苏氨酸——tRNA连接酶	P0A8M5	细节
肽蛋氨酸亚砜还原酶同行	P0A745	细节
Ribose-5-phosphate异构酶一	P0A7Z3	细节
N-acetylneuraminate裂合酶	P0A6L6	细节
水通道蛋白Z	O68874	细节
Ribosome-recycling因素	P0A808	细节
Phosphopantetheine adenylyltransferase	P0A6I8	细节
硫代硫酸盐sulfurtransferase GlpE	P0A6V7	细节
L-fucose异构酶	P69923	细节
三磷酸鸟苷cyclohydrolase 1	P0A6T8	细节
Adenylosuccinate合成酶	Q83P33	细节
3-hydroxydecanoyl -酰基载体蛋白质脱水酶	P0A6Q5	细节
丝氨酸hydroxymethyltransferase	P0A827	细节
延长因子图	Q83JC4	细节
Formyl-CoA:草酸CoA-transferase	P69903	细节
甲基乙二醛合酶	P0A733	细节
Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase 2	P61888	细节
天冬氨酸carbamoyltransferase催化链	P0A789	细节
Thymidylate激酶	P0A721	细节
tRNA (guanine-N(1) -甲基转移酶	P0A876	细节
Nicotinate-nucleotide adenylyltransferase	P0A753	细节
触发因素	P0A852	细节
蛋白质RecA	P0A7G9	细节
ATP-dependent蛋白酶atp酶亚基HslU	P0A6H7	细节
Geranyltranstransferase (Farnesyldiphosphate合成酶)	A0A0H2UXE9	细节