桥接水锚拴在5 - 2 (3-aminopropyl)的DNA脱氧尿苷胺主要槽近似的N + 2 C。对形成interstrand 5 G碱基对:影响氮芥茉-GNC-3的交叉连接。
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李王F, F, Ganguly M,挞伐,黄金B,艾格力,石头议员
桥接水锚拴在5 - 2 (3-aminopropyl)的DNA脱氧尿苷胺主要槽近似的N + 2 C。对形成interstrand 5 G碱基对:影响氮芥茉-GNC-3的交叉连接。
生物化学。2008年7月8日,47 (27):7147 - 57。doi: 10.1021 / bi800375m。Epub 2008年6月13日。
- PubMed ID
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18549246 (在PubMed]
- 文摘
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特定站点插入5 - (3-aminopropyl) 2的脱氧尿苷(Z3dU)和7-deaza-dG Dickerson-Drew dodecamers 5 ' - d (C C G (1) (2) (3) G (4) (5) (6) (7) T (8) (9) Z (10) C G (11) (12)) 3”。5 ' - d (C (13) G (14) C G (15) (16) (17) (18) T (19) (20) C (21) Z (22) C G(23)(24) 3 '(名为DDD (Z10))和5’- d (C C G (1) (2) (3) G (4) (5) (6) (7) X (8) C T (9) Z (10) C G (11) (12)) 3 '。5 ' - d (C (13) G (14) C G (15) (16) (17) (18) T (19) X Z (20) C (21) (22) C G(23)(24) 3 '(名为DDD (2 + Z10)) (X = Z3dU;Z = 7-deaza-dG)表明一个机制的形成interstrand N + 2 DNA使交联氮芥茉,例如,美法仑和氮芥。DDD的分析(2 + Z10)双显示,拴在阳离子在碱基对(5)方式(20)和X(8)。(17)扩展主要槽内3 '方向,对守恒的镁(2 +)结合位点位于毗邻N + 2碱基对C(3)还是Z Z(22)和(10)。C (15)。之间的桥梁水域位于拴在胺和Z(10)或Z (22) O(6)稳定拴在阳离子和允许交互与N + 2 DNA碱基对没有弯曲。整合7-deaza-dG DDD (2 + Z10)双减弱但不消除静电系胺之间的相互作用和Z Z (10) O(6)和(22)O(6)。结果表明机制受N7-dG aziridinium离子活性物种参与形成interstrand 5 -GNC-3的交叉连接的氮芥茉,修改静电学的主要槽和位置aziridinium离子直接的主要坡口边缘N + 2 C。G碱基对,促进interstrand交联。