从荧光假犬尿氨酸酶的三维结构。
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Momany C, Levdikov V, Blagova L,利马,菲利普斯RS
从荧光假犬尿氨酸酶的三维结构。
生物化学。2004年2月10日,43 (5):1193 - 203。
- PubMed ID
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14756555 (在PubMed]
- 文摘
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犬尿氨酸酶[。3.7.1.3]是pyridoxal-5磷酸(PLP)端依赖酶催化的水解乳沟l-kynurenine邻氨基苯甲酸和丙氨酸。与其他PLP-dependent酶序列比对表明犬尿氨酸酶在子群IVa转氨酶,连同nifS, CsdB, serine-pyruvate转氨酶,表明犬尿氨酸酶有转氨酶褶皱。晶体的荧光假犬尿氨酸酶获得,分子结构是解决替代使用CsdB坐标结合多个同形重原子替换。坐标是存入PDB (ID代码1 qz9)。结构、改进的R因子15.5%,至1.85一项决议,是二聚的转氨酶褶皱。结构也证实了预测序列比对,赖氨酸- 227是PLP-binding残留在p .荧光犬尿氨酸酶。守恒的asp - 201,预计转氨酶褶皱,附近,氮,但asp - 132也处于相似的距离严格守恒和吡啶氮。诱变的守恒的天冬胺酸显示两个同样有助于PLP绑定,但asp - 201在催化方面发挥更大的作用。结构表明,酪氨酸- 226捐赠氢键PLP的磷酸。 Unusual among PLP-dependent enzymes, Trp-256, which is also strictly conserved in kynureninases from bacteria to humans, donates a hydrogen bond to the phosphate through the indole N1-hydrogen.