结构和功能特征的人类CCR5受体在复杂与艾滋病毒包膜糖蛋白gp120和CD4受体分子建模研究。
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刘、风扇、太阳Z
结构和功能特征的人类CCR5受体在复杂与艾滋病毒包膜糖蛋白gp120和CD4受体分子建模研究。
J摩尔模型。2003年10月,9 (5):329 - 36。Epub 2003年8月29日。
- PubMed ID
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14517611 (在PubMed]
- 文摘
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人类免疫缺陷病毒(HIV)进入细胞取决于序列的交互gp120包膜糖蛋白与CD4细胞受体和趋化因子受体家族的成员。CC趋化因子受体CCR5是几种趋化因子和受体的主要coreceptor R5艾滋病病毒1型(HIV - 1)进入细胞。尽管许多研究关注的交互与hiv - 1 CCR5,相应的交互网站CCR5和gp120尚未匹配。这里我们使用一个方法结合蛋白质结构建模、对接和分子动力学模拟建立一系列的结构性模型与gp120和CD4 CCR5的复合物。相互作用,如氢键、盐桥和范德华接触CCR5和gp120进行调查。三的快照CCR5-gp120-CD4模型显示,最初的交互CCR5与带负电荷的n端gp120参与(Nt)地区的CCR5地区gp120和带正电的桥接表。进一步交互发生在细胞外loop2 (ECL2) CCR5和V3环地区gp120的基础。这些相互作用诱导的构象变化gp120和可能导致最终的艾滋病毒进入细胞。这些结果不仅大力支持两步gp120-CCR5绑定机制,也合理化广泛生物数据的角色在hiv - 1抗体来源于CCR5绑定和条目,并可引导努力设计新颖的抑制剂。beplayapp