Raltegravir灵活性和它对识别目标的hiv - 1的影响。

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Arora R, de Beauchene IC,波兰斯基J,莱恩E, Tchertanov L

Raltegravir灵活性和它对识别目标的hiv - 1的影响。

J摩尔Recognit。2013年9月26日(9):383 - 401。doi: 10.1002 / jmr.2277。

PubMed ID

23836466 (在PubMed

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hiv - 1是一个相关的目标发展的辅助化疗。第一个在特定抑制剂批准用于治疗艾滋病毒/艾滋病、、、是为了阻止圣反应。我们为特征的结构和构象特征、及其识别通过假定的hiv - 1目标——释放,vDNA, * vDNA复杂——模仿在国家一体化进程。、绑定到目标,研究了通过执行一个广泛的抽样抑制剂构象景观和通过使用四个不同的对接算法:滑翔,Autodock,七弦琴,SurFlex。获得的数据证明:(i)大绑定口袋划定的活性部位和延长循环的在适应不同的构象州、缺乏特定的相互作用与目标;(2)一个定义良好的空腔形成的活性部位,vDNA,和缩短循环在* vDNA复杂提供更优化的抑制剂结合位点的文化、螯合物镁(2 +)阳离子;(3)之间的特定的识别、和未配对的胞嘧啶处理DNA是由一对强劲H-bonds DNA碱基对g c中所观察到的类似。的确定、姿势裂解vDNA阐明一个假定的步骤、抑制机制。这个模型研究表明,抑制过程可能包括作为第一步处理、识别的vDNA绑定到一个短暂的中间状态,从而提供了一个潜在的有前途的途径的设计与改进的亲和力和选择性抑制剂。

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Raltegravir