应变比静电作用更重要在控制天冬氨酸转氨酶催化的pKa集团。
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哈亚希Mizuguchi H, H,冈田克也K, Miyahara我Hirotsu K, Kagamiyama H
应变比静电作用更重要在控制天冬氨酸转氨酶催化的pKa集团。
生物化学。2001年1月16日,40 (2):353 - 60。
- PubMed ID
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11148029 (在PubMed]
- 文摘
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系统的单个和多个替代研究已经应用于大肠杆菌天冬氨酸转氨酶探针的静电效应两个substrate-binding精氨酸残基,Arg292 Arg386,吡哆醛的结构效应5 -phosphate-Asn194-Arg386连杆形成氢键系统(PLP-N-R)的pK (a)值之间形成席夫碱吡哆醛5 '磷酸(PLP)和Lys258。两个精氨酸残基的静电效应不能通过简单的残基的突变研究。PLP-N-R降低的pK (a)价值PLP-Lys258席夫碱通过保持它扭曲构象,这对质子化作用是不利的。突变Arg386消除与Asn194和部分破坏PLP-N-R氢键,从而放松席夫碱的菌株。Arg292另一方面,突变,大域残渣与小域Asp15残留,使域开放更容易。因为PLP-N-R两个域之间的谎言,域开放增加了席夫碱的菌株。因此,真正的静电效应Arg292 Arg386可能源于突变分析的酶PLP-N-R Asn194Ala突变被完全破坏了。通过分析,我们可以解剖的静电和结构影响精氨酸席夫碱pK (a)的突变。两个精氨酸残基的正电荷的PLP-N-R-mediated应变席夫碱降低席夫碱pK(一)0.7和1.7,分别。因此,精氨酸残基的静电效应并不如历来认为,和这一发现具体化的imine-pyridine扭转我们最近发现席夫碱(2.8单元减少)的基本决定因素是极低的pK (a)的席夫碱值[Hayashi H。Mizuguchi, H。, and Kagamiyama, H. (1998) Biochemistry 37, 15076-15085].