快照在酶反应坐标:分析保留beta-glycoside水解酶。
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戴维斯GJ, Mackenzie L, Varrot爱抚M, Brzozowski, Schulein M,威瑟斯SG
快照在酶反应坐标:分析保留beta-glycoside水解酶。
生物化学。1998年8月25日,37(34):11707 - 13所示。
- PubMed ID
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9718293 (在PubMed]
- 文摘
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O-glycosidic联系的酶法水解是最多样化和广泛的反应在自然界中,涉及到一个经典的“教科书”酶机制。的多学科分析beta-glycoside水解酶,从芽孢杆菌Cel5A agaradhaerens,提出每个本机的结构,底物,covalent-intermediate,和产品配合物已经确定,他们互变现象分析活动,提供前所未有的见解这类酶的机制。基质是绑定在一个扭曲1 s3 skew-boat构象,从而呈现异头碳亲核攻击以及适当满足立体要求oxocarbenium离子也渐露端倪。离去基团离去的捕获的共价alpha-glycosyl-enzyme中间糖采用无畸变的4 c1构象。最后,水解的中间产品收益率复杂的糖是绑定在一个部分无序模式,符合不利的相互作用和低亲和力的产品。