2-methylisocitrate裂合酶的晶体结构(PrpB)大肠杆菌和造型的配体结合活性中心。
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引用
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格林C,埃弗斯布鲁克M, Maerker C, Klebe G上W,路透社K
2-methylisocitrate裂合酶的晶体结构(PrpB)大肠杆菌和造型的配体结合活性中心。
J杂志。2003年5月2日,328(3):609 - 21所示。
- PubMed ID
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12706720 (在PubMed]
- 文摘
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乙酸,丙酸是第二个最丰富的土壤中含有的低分子质量的碳化合物。许多微生物,包括大多数,如果不是所有的真菌,以及一些有氧细菌,如大肠杆菌和沙门氏菌血清氧化丙酸通过methylcitrate周期。这种酶2-methylisocitrate裂合酶(PrpB)大肠杆菌催化这个周期的最后一步,2-methylisocitrate乳沟的丙酮酸和琥珀酸结晶及其结构决定分辨率为1.9。酶,严格依赖于镁(2 +)催化、属于异柠檬酸裂解酶的蛋白质家族。这种酶家族成员的共同特性是一个所谓的“活性部位循环”的运动从开放到封闭的构象在衬底绑定因此屏蔽反应物从周围的溶剂。PrpB包含自提出结构,除了镁(2 +),没有配体,活性部位循环是发现在一个开放的构象。然而,这种构象显著不同于开放构型存在ligand-free迄今为止已知结构的异柠檬酸裂解酶。可能影响的观察对异柠檬酸裂解酶的不同反应和PrpB治疗常见抑制剂3-bromopyruvate进行了探讨。基于配体的结构从结核分枝杆菌异柠檬酸裂解酶的模型substrate-bound PrpB酶在其封闭的构象创建提供提示对这种酶的底物特异性。