鸟型分支杆菌亚种副结核的完整基因组序列。
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李L, Bannantine JP,张问,Amonsin, BJ, Alt D,纳杰N, Kanjilal年代,Kapur V
鸟型分支杆菌亚种副结核的完整基因组序列。
《美国国家科学院刊S a . 2005年8月30日;102 (35):12344 - 9。Epub 2005年8月22日。
- PubMed ID
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16116077 (在PubMed]
- 文摘
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我们在这里描述的完整基因组序列的常见克隆鸟结核分枝杆菌亚种副结核(地图)应变K-10的病原体在牛和其他反刍动物慢性细菌性肠炎。K-10基因组是一个圆形的4829781个碱基对的染色体和4350预测orf编码,45图示,rRNA操纵子。在计算机分析识别> 3000个基因与人类病原体同系物,结核分枝杆菌(Mtb),和161年基因编码39未知的地图独特的基因组区域。分析核苷酸替代率与Mtb同系物建议这些共享的总体强劲的绝大多数选择分枝杆菌基因,只有68羊痘疮的同义替换产生的比> 2。比较的K-10基因组序列分析揭示了几个值得注意的特性包括:相对缺乏的PE / PPE家庭与毒力因素的序列和已知免疫刺激性结核分枝杆菌在感染;截断的烤鸭域salicyl-AMP连接酶(优先),第一个基因mycobactin生物合成基因簇,提供一个可能的解释mycobactin地图的依赖;和映射为特定序列可能作为敏感的潜在目标和特定的分子和免疫诊断测试。综上所述,完整的基因组序列的可用性研究提供了一个基础的遗传毒性和生理基础地图,使开发的新一代牛慢性细菌性肠炎的诊断测试。