dna结合域的解决方案结构的NtrC三丙氨酸替换。
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水斗式詹,Kustu年代,电话
dna结合域的解决方案结构的NtrC三丙氨酸替换。
J杂志。1999年10月8日,292 (5):1095 - 110。
- PubMed ID
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10512705 (在PubMed]
- 文摘
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20 kDa的结构c端dna结合域的NtrC鼠伤寒沙门氏菌(残留Asp380-Glu469)和丙氨酸取代Arg456, Asn457 Arg461,是由核磁共振光谱学。NtrC是homodimeric enhancer-binding蛋白质激活基因转录的氮代谢所需的产品。残91 - c端域包含二聚作用所需的决定因素和完整的dna结合蛋白质。结合DNA突变蛋白不但是保留许多野生型蛋白的特点,和突变体域表达在高收益率在基本培养基(20 mg / l)。三维(1)H / (13) C / (15) N triple-resonance, (1) H ~ (13) C - (13) C - H(1)相关性和(15)N-separated核奥佛好塞效应(一)光谱学实验用于制造骨干和侧链(1),(15)N, (13) C作业。结构计算使用1580内部和inter-monomer距离和氢键限制(88氢键;44氢键限制),和88年φ二面角限制通过Glu469残留Asp400单体。共有54个模棱两可的限制(内部或inter-monomer)涉及残留接近2倍的对称轴也包括在内。每个单体由四个螺旋段。螺旋(Trp402-Leu414)和B (Leu421-His440)加入与另一个单体形成反平行的四螺旋包。 Helices C (Gln446-Leu451) and D (Ala456-Met468) of each monomer adopt a classic helix-turn-helix DNA-binding fold at either end of the protein. The backbone rms deviation for the 28 best of 40 starting structures is 0.6 (+/-0.2) A. Structural differences between the C-terminal domain of NtrC and the homologous Factor for Inversion Stimulation are discussed.