的光敏黄色蛋白质一级结构光养细菌外硫红螺菌属halophila,证据的质量和发色团的结合位点。
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Van Beeumen JJ, Devreese BV,范包子SM,霍夫WD, Hellingwerf KJ, Meyer TE, McRee DE Cusanovich MA
的光敏黄色蛋白质一级结构光养细菌外硫红螺菌属halophila,证据的质量和发色团的结合位点。
蛋白质科学。1993年7月,2(7):1114 - 25所示。
- PubMed ID
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8358295 (在PubMed]
- 文摘
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完整的氨基酸序列125 -残留的黄色光活化的蛋白质(PYP)从外硫红螺菌属halophila已经确定为MEHVAFGSEDIENTLAKMDDGQLDGLAFGAIQLDGDGNILQYNAAEGDITGRDPKEVIGKNFFKDVAP + + + CTDSPEFYGKFKEGVASGNLNTMFEYTFDYQMTPTKVKVHMKKALSGDSYWVFVKRV。这是第一个报告这类蛋白质序列。没有明显的其他蛋白质序列同源性,尽管晶体结构,在2.4一项决议(McRee D.E.et al ., 1989年,Proc。国家的。学会科学。美国86年、6533 - 6537),表明关系同样大小的脂肪酸结合蛋白(FABP),代表一个家庭的真核蛋白质结合疏水分子。氨基酸序列的展品没有FABP和PYP相似性大于蛋白质随机(8%)。黄色光活化的蛋白包含一个身份不明的发色团是由光漂白,但在第二个复苏。在这里,我们表明,发色团必然共价半胱氨酸69而不是赖氨酸111从晶体结构分析推导。酪氨酸的部分暴露侧链76年,94年和118年,加上Trp 119似乎是安排在一个集群中,可能变得更加暴露由于蛋白质的构象变化所产生的光致发色团漂白。带电残基在蛋白质表面不均匀分布,但安排在积极和消极集群两边的蛋白质。 The exact chemical nature of the chromophore remains undetermined, but we here propose a possible structure based on precise mass analysis of a chromophore-binding peptide by electrospray ionization mass spectrometry and on the fact that the chromophore can be cleaved off the apoprotein upon reduction with a thiol reagent. The molecular mass of the chromophore, including an SH group, is 147.6 Da (+/- 0.5 Da); the cysteine residue to which it is bound is at sequence position 69.