重新调查formyl-CoA转移酶的催化机制,第三类CoA-transferase。
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丰田CG,理查兹NG Berthold CL Lindqvist Y
重新调查formyl-CoA转移酶的催化机制,第三类CoA-transferase。
J生物化学杂志。2008年3月7日,283 (10):6519 - 29。Epub 2007年12月27日。
- PubMed ID
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18162462 (在PubMed]
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Formyl-coenzyme转移酶从Oxalobacter formigenes属于第三类辅酶A转移酶家族之间的辅酶A载体和催化可逆转移formyl-CoA和草酸,形成oxalyl-CoA和甲酸。Formyl-CoA转移酶具有独特的三维折叠组成的两个交错单元像环链锁在一起。我们这里存在一个中间在反应中,formyl-CoA转移酶包含共价beta-aspartyl-CoA硫酯,采用不同的构象两个活动网站的二聚体,这是通过晶体freeze-trapping实验确定formyl-CoA和oxalyl-CoA受体羧酸的缺失。的形成enzyme-CoA硫酯也证实了质谱数据。进一步的结构性数据包括一个困aspartyl-formyl酐甘氨酸循环关闭保护活性部位。的晶体结构beta-aspartyl-CoA硫酯的活性突变体变种,草酸被发现绑定到开放构型的甘氨酸循环。与羟胺捕获实验和动力学以及诱变数据,这些formyl-CoA转移酶复合物的结构提供新的信息第三类CoA-transferase家人和催化步骤提示重新定义和修改formyl-CoA转移酶的反应机理提出了这里。