2.9晶体结构的ligand-free tryptophanyl-tRNA合成酶:域运动片段腺嘌呤核苷酸结合位点。
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Ilyin VA,寺庙B,胡锦涛M,李G,阴Y, Vachette P,卡特CW Jr
2.9晶体结构的ligand-free tryptophanyl-tRNA合成酶:域运动片段腺嘌呤核苷酸结合位点。
蛋白质科学。2000年2月,9(2):218 - 31所示。
- PubMed ID
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10716174 (在PubMed]
- 文摘
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的晶体结构ligand-free tryptophanyl-tRNA合成酶(TrpRS)解决了2.9使用分子置换和最大熵的组合图/阶段改进。二聚的结构(R = 23.7, Rfree = 26.2)是不对称的,不同的TrpRS tryptophanyl-5'AMP复杂(TAM;Doublie年代,Bricogne G, Gilmore CJ,卡特连续波小,1995年,结构3:17-31)。同意小角度解决x射线散射实验,unliganded TrpRS构象中单体敞开,只留下tryptophan-binding地区活跃的站点完好无损。的氨基末端alphaA-helix、TIGN KMSKS签名序列,和远端螺旋域作为一个刚体旋转远离dinucleotide-binding褶皱域,打开音箱结合位点,TAM的复杂,成两半。的侧链的包装比较ligand-free TrpRS TAM复杂,使用的识别极性的核(1994年Ilyin VA,蛋白质Eng 7:1189 - 1195),表明重大改装之间发生三个相对稳定的核心区域,其中一个作为轴承在另两个之间。这些域重组提供了一个新的结构模式是一致的详细的“诱导契合”机制提出了TyrRS Fersht et al。(Fersht AR Knill-Jones JW Beduelle H,冬天G, 1988年生物化学27:1581 - 1587)。ATP结合相关因素耦合的两个催化签名序列到螺旋域包含假定anticodon-binding网站提供了一种机制来协调与搬迁的主要活性部位化学tRNA约束力的决定因素。