从联合序列到统一序列:十年后枯草芽孢杆菌168参考基因组。
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Barbe V, Cruveiller S, Kunst F, lennoble P, Meurice G, Sekowska A, valenet D, Wang T, Moszer I, medue C, Danchin A
从联合序列到统一序列:十年后枯草芽孢杆菌168参考基因组。
微生物学，2009;55(6):1758-75。doi: 10.1099 / mic.0.027839-0。2009年4月21日。
- PubMed ID
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19383706 (PubMed视图］
- 摘要
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比较基因组学是基因功能鉴定的基石。除了少数模式生物外，数量巨大的生物体妨碍了对功能的实验鉴定。细菌区域被分成大的分支，其中厚壁菌门占据了相当大的空间。枯草芽孢杆菌几十年来一直是厚壁菌门的模型，其基因组10多年来一直是参考。基因组测序涉及30多个实验室，他们拥有不同的专业知识，试图充分利用可能与序列相关的实验信息。这有一个预期的缺点，那就是测序专业知识在涉及的小组之间差异很大，特别是在测序基因组非常困难的时候。近年来，高效、快速和准确的测序技术的发展，以及高水平注释平台的发展，推动了当前的重测序工作。更新后的序列被重新标注，与UniProt蛋白质知识库一致，保持了古生物组(维持和延续生命所需的基因)和基因组(占据生态位所需的基因，这里表明枯草芽孢杆菌是一种附生真菌)之间的分裂。这应该允许研究人员做出可靠的推断，准备在细菌生长和发育的各种领域的验证实验，以及建立准确的系统发育。