大肠杆菌的x射线晶体结构周质的蛋白质FhuD绑定到hydroxamate-type含铁细胞和白霉素抗生素。
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克拉克TE,布劳恩V,温克尔曼G,塔里LW沃格尔HJ
大肠杆菌的x射线晶体结构周质的蛋白质FhuD绑定到hydroxamate-type含铁细胞和白霉素抗生素。
J生物化学杂志。2002年4月19日,277 (16):13966 - 72。Epub 2002年1月22日。
- PubMed ID
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11805094 (在PubMed]
- 文摘
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Siderophore-binding蛋白质起着关键作用的吸收铁在许多革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌。FhuD是一磷酸腺苷cassette-type (ABC-type)结合蛋白参与吸收hydroxamate-type含铁细胞在大肠杆菌。FhuD结构包裹着抗生素白霉素、真菌含铁细胞coprogen和药物Desferal已经决定在高分辨率x射线晶体学。FhuD有一个不寻常的bilobal周质的配体结合蛋白的结构,连接着两个β/α混合域由一个长阿尔法螺旋。hydroxamate-type配体的结合位点是由浅口袋,位于这两个域之间。识别的主要含铁细胞发生通过iron-hydroxamate中心各含铁细胞之间的相互作用和几个关键残基的侧链绑定的口袋里。内的侧链重组绑定口袋容纳每个含铁细胞的独特的结构特点。含铁细胞的脊椎没有参与任何直接与蛋白质的相互作用,展示如何用相当大的含铁细胞化学和结构多样性FhuD可以绑定。白霉素、由抗生素组附加到hydroxamate含铁细胞,电子密度的抗生素部分没有被观察到。因此,这项研究提供了一个基础的理性设计新颖的抑菌剂,siderophore-antibiotic形式的配合,可以作为“特洛伊木马”,使用hydroxamate-type含铁细胞吸收系统,积极提供抗生素直接进入目标病原体。