精制adenylosuccinate合成酶的晶体结构大肠杆菌包裹着hydantocidin 5 '磷酸、GDP、HPO4 (2 -), Mg2 +和hadacidin。
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波兰BW,李科幻,萨勃拉曼尼亚MV, Siehl DL,安德森RJ,弗洛姆HJ Honzatko RB
精制adenylosuccinate合成酶的晶体结构大肠杆菌包裹着hydantocidin 5 '磷酸、GDP、HPO4 (2 -), Mg2 +和hadacidin。
生物化学。1996年12月10日,35 (49):15753 - 9。
- PubMed ID
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8961938 (在PubMed]
- 文摘
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从大肠杆菌adenylosuccinate合成酶的晶体结构,包裹着5 '磷酸、GDP、HPO4 (2 -), Mg2 + hadacidin在100 K,已经精炼的Rfactor 0.195 2.6数据分辨率。债券的长度和角度偏离预期值0.012和1.86度,分别。赖氨酸16和骨干酰胺和42个15 - 17日与GDP的磷酸盐,而爵士414年333 Asp,骨干酰胺331年和416年与基础。Mg2 +是八面体的协调。氧原子从GDP、磷酸和hadacidin定义协调的赤道平面Mg2 +,而骨干羰基40和Asp的侧链13顶配体。HPO4(2 -)氢键与赖氨酸16,他41岁的骨干酰胺13,40岁,224年,基地hydantocidin抑制剂的一部分。Arg hadacidin的羧酸盐与303年和301年刺;N-formyl组坐标Mg2 +和羟基氢键与Asp 13。5 '磷酸的hydantocidin抑制剂与Asn 38岁,129年刺,刺239但大约是3.5从143年Arg(由分子2倍对称相关)。的基本一半hydantocidin 5 '磷酸氢键Gln 224和参与氢键网络,包括磷酸分子,一些水分子,和Asp 13。 Hydantocidin 5'-phosphate, GDP, HPO4(2-), and Mg2+ may represent a set of synergistic inhibitors even more effective than the combination of IMP, GDP, NO3-, and Mg2+.