空化机制的衬底歧视,adenylosuccinate合成酶。
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周Iancu简历,Y, Borza T,弗洛姆HJ Honzatko RB
空化机制的衬底歧视,adenylosuccinate合成酶。
生物化学。2006年9月26日,45 (38):11703 - 11。
- PubMed ID
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16981730 (在PubMed]
- 文摘
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Adenylosuccinate合成酶催化中的第一个关键步骤新创生物合成的AMP,耦合L-aspartate,形成Adenylosuccinate进出口权。IMP和2的-deoxy-IMP公里值几乎相同,每个基质支持类似的最大速度。尽管如此,L-aspartate的Km值和Ki值hadacidin(竞争性抑制剂对L-aspartate)是在小孩面前29-57-fold低于2》-deoxy-IMP的存在。的晶体结构与hadacidin合成酶的结扎,GDP和6-phosphoryl-IMP或2”-deoxy-6-phosphoryl-IMP是相同的除了腔的存在通常占据2的羟基群小鬼。6-phosphoryl-IMP和GDP (hadacidin缺席),L-aspartate口袋可以保留其完全结扎构象,2的羟基之间形成氢键群小鬼和sequence-invariant残留物。在2的-deoxy-6-phosphoryl-IMP和GDP, L-aspartate口袋不好订购。没有2羟基组的脱氧核苷酸可能破坏绑定L-aspartate口袋的配体的破坏氢键,保持一个良好的蛋白质构象和引入腔完全结扎活性部位。在一个近似的能量消耗为2.2千卡/摩尔,空泡形成可能的不利的热力学不稳定的主要因素的配体L-aspartate口袋里。