独特的功能显示不动杆菌基因组序列的sp。ADP1,多才多艺,自然转换能力的细菌。
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" V, Vallenet D, Fonknechten N, Kreimeyer, Oztas年代,拉贝尔L, Cruveiller年代,罗伯特·C Duprat年代,Wincker P, Ornston LN, Weissenbach J, Marliere P,科恩GN, Medigue C
独特的功能显示不动杆菌基因组序列的sp。ADP1,多才多艺,自然转换能力的细菌。
核酸研究》2004年10月28日,32 (19):5766 - 79。打印2004。
- PubMed ID
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15514110 (在PubMed]
- 文摘
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不动杆菌sp.应变ADP1是营养的土壤细菌密切相关特征明显的代表绿脓杆菌和假单胞菌putida。与这些细菌不同,不动杆菌ADP1高度胜任自然转换提供非凡的遗传操作方便。环形染色体的不动杆菌ADP1,这里介绍,编码3325预测编码序列,其中60%已经基于序列相似性分类到其他记录的蛋白质。不动杆菌和假单胞菌的物种的进化相近,根据他们的16 s RNA基因的序列和最高水平的双向最好,与广泛的的GC含量差异DNA(40比62%)。染色体也大小差别很大,不动杆菌ADP1染色体< 60%的假单胞菌的长度。不动杆菌的基因组分析ADP1揭示代谢途径的基因参与多种化合物的利用率。几乎所有这些基因,与直接同源分散在其他物种,位于五大“岛屿的分解代谢的多样性”,现在明显分解代谢的多样性的群岛,在整个基因组的四分之一。不动杆菌ADP1显示其他有氧土壤细菌代谢的许多特性面向有机化合物在自然栖息地的退化。这个基因组的特点是缺乏一个基因对应的丙酮酸激酶,一般的酶催化碳水化合物转化为丙酮酸的终端一步柠檬酸循环呼吸。这个发现支持这样的观点,即周期本身是中央为了这个特别的分解能力的有机体。