一个新的子类的锌metalloproteases总科肽deformylase结构显示的解决方案。
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Meinnel T, Blanquet年代,Dardel F
一个新的子类的锌metalloproteases总科肽deformylase结构显示的解决方案。
J杂志。1996年9月27日,262 (3):375 - 86。
- PubMed ID
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8845003 (在PubMed]
- 文摘
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大肠杆菌肽deformylase,锌metalloproteases家族的一员,是由一个活跃的核心域由147残留物和额外的和可有可无的21 c端尾部的残留物。三维结构的催化核心可以通过核磁共振研究。1 h和15 n核磁共振共振作业是通过二维和三维杂环的光谱。结构可以使用一组计算1015限制为147年残留的酶。的整体结构是由一系列的反平行的beta-strands环绕两个垂直阿尔法螺旋。c端螺旋包含HEXXH主题,活动是至关重要的。这个螺旋安排和组氨酸结合锌离子的方式显然是结构让人想起metalloprotease家族的其他成员,如嗜热菌蛋白酶或metzincins。然而,布局的二级和三级结构肽deformylase和第三锌配位体的定位(半胱氨酸)非常不同于家庭的其他成员。这些差异,加上几个生化差异,导致我们建议的第一个例子是肽deformylase zinc-metalloproteases家族的一个新类。肽的相互作用的研究deformylase与抑制剂的反应或对产品的催化反应,Met-Ala-Ser,以及与家庭的其他酶的结构,使我们能够描述该地区相应的结合位点。 The structural basis of the specificity of recognition of the formyl group is discussed in the context of the protease superfamily.