解决方案的结构nickel-peptide deformylase。
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Dardel F,拉古萨年代,Lazennec C, Blanquet年代,Meinnel T
解决方案的结构nickel-peptide deformylase。
J杂志。1998年7月17日,280(3):501 - 13所示。
- PubMed ID
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9665852 (在PubMed]
- 文摘
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摘要伴随我们报告锌不太可能协同因素支持体内肽deformylase活动。相反,镍结合促进酶活性。由此产生的三维结构nickel-containing肽deformylase(催化领域,残留1到147)是解决使用13核磁共振c-15n-doubly标记蛋白样品。一组2261年限制可以收集,每个氨基酸平均为15.4。决议,这显示了一个好的定义大多数侧链的位置,相比大大提高,zinc-containing之前报道,活动形式。比较两个汉斯表明然而共享相同的3 d组织。这表明绑定金属的性质是这种酶的水解活性的主要决定因素。定点诱变使我们能够确定PDF的守恒的残留活性部位的结构。特别是,埋精氨酸似乎Cys90的定位至关重要,金属配体之一。此外,三维结构的肽deformylase嗜热菌蛋白酶相比,metzincins。 Although the structural folds are very different, they all display a common structural motif involving an alpha-helix and a three-stranded beta-sheet. These conserved structural elements build a common scaffold which includes the active site, suggesting a common hydrolytic mechanism for these proteases. Finally, an invariant glycine shared by both PDF and metzincins enables us to extend the conserved motif from HEXXH to HEXXHXXG.