结构分析的配体结合和催化chorismate裂合酶。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
史密斯N, Roitberg AE,里维拉E,霍华德,霍尔顿MJ,梅休M, Kaistha年代,加拉格尔DT
结构分析的配体结合和催化chorismate裂合酶。
拱生物化学Biophys。2006年1月1;445 (1):72 - 80。Epub 2005年11月22日。
- PubMed ID
-
16343413 (在PubMed]
- 文摘
-
Chorismate裂合酶(CL)删除pyruvyl集团从Chorismate提供4-hydroxybenzoate辅酶q通道(4 hb)。我们之前报道的1.4分辨率晶体结构大肠杆菌与绑定4 CL hb产品,显示背后的产品绑定在一个内部腔两皮瓣。提供一个更完整的基础理解CL的不寻常的配体结合属性和作用机制,我们现在报告4 CL突变体和抑制剂复合物的晶体结构,一起绑定和活动测量和分子动力学模拟。首先,超高分辨率(1.0)晶体结构的CL *产品复杂揭示substrate-sized内部空腔的细节,还背后的皮瓣,在产品的网站。第二,2.4 CL结构包裹着抑制剂香子兰酸盐显示皮瓣部分相对于product-bound打开位置。第三,2.0 G90A突变与绑定产品的结构揭示了更严格的产品绑定和动态的基础这种活性位点突变的影响。第四,G90A突变与香子兰酸盐抑制剂的结合产生一个1.9一个包含两个抑制剂分子结构,一个在产品网站和其他相邻腔。两个网站的连接短隧道部分开放的两端,这表明CL可能通过第二或隧道运营机制。