结构基础的生物素生物合成的抑制抗生素amiclenomycin。
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Sandmark J,施耐德曼年代,Marquet, G
结构基础的生物素生物合成的抑制抗生素amiclenomycin。
生物化学杂志。2002年11月8日;277 (45):43352 - 8。Epub 2002 9月5。
- PubMed ID
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12218056 (在PubMed]
- 文摘
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抗生素amiclenomycin街区的生物合成生物素通过抑制pyridoxal-phosphate-dependent酶diaminopelargonic酸合酶。酶的失活是立体选择,即amiclenomycin的顺式异构体是一个强有力的抑制剂,而反式异构体的活性要少得多。全酶的晶体结构的复杂和amiclenomycin 1.8分辨率显示,内部醛亚胺键之间的代数余子式和侧链的催化残基赖氨酸- 274是坏了。相反,之间的共价键形成4-amino amiclenomycin氮和C4吡哆醛磷酸盐的碳原子。绑定的电子密度抑制剂表明芳构化的环己二烯环发生共价加合物的形成。这个过程可能是由质子抽象的C4碳原子环己二烯环,可能近端侧链的赖氨酸- 274,导致互变异构体席夫碱紧随其后的第二个烯丙基的氢。的羧基尾巴amiclenomycin一部分形成盐链接守恒的残渣arg - 391 substrate-binding站点。建模显示位阻在活性部位的行列式弱抑制效力的反式异构体。