结构性基础5 '磷酸吡哆醇合成酶的功能。
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佛朗哥毫克,标签B, Huber R,克劳森T
结构性基础5 '磷酸吡哆醇合成酶的功能。
结构。2001年3月7日,9 (3):245 - 53。
- PubMed ID
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11286891 (在PubMed]
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背景:吡哆醛5 '磷酸是维生素B的活性形式(6)作为一个重要,无处不在的氨基酸代谢的辅酶。在大肠杆菌中,新创生物合成的途径维生素B(6)导致吡哆醇的形成5 '磷酸(PNP),它可以被视为第一个合成B(6)人。PNP型合酶(通常称为PdxJ)是一个homooctameric酶催化这个途径的最后一步,1-deoxy-D-xylulose-5之间的复杂的分子内缩合反应的磷酸和1-amino-acetone-3-phosphate。结果:大肠杆菌PNP型合酶的晶体结构是解决单一同形替代反常散射和精制2.0的决议。PNP型合酶由一个紧凑的域的单体,采用丰富的蒂姆桶褶皱。Intersubunit联系人由三个额外的螺旋线,各自的古典蒂姆桶螺旋,生成对称的四聚物二聚体有422对称。在共享活动的场所活动二聚体,Arg20是单体直接参与底物结合的伙伴。此外,PNP型合酶的结构与其生理产品,PNP型和P (i),确定分辨率2.3,它提供了洞察酶的动态动作和允许我们识别氨基酸酶功能的关键。结论:自由酶的高分辨率结构和大肠杆菌的enzyme-product复杂PNP合成酶建议酶机制的必需品。主要的催化特性是活跃的站点关闭在衬底绑定重排的蒂姆•桶的一个c端循环charge-charge稳定的质子化了的席夫碱中间,两个磷酸结合位点的存在,水通道,穿透了β桶,允许释放水分子处于关闭状态。 All related PNP synthases are predicted to fold into a similar TIM barrel pattern and have comparable active site architecture. Thus, a common mechanism can be anticipated.