Enzyme-ligand复合物的吡哆醇5 '磷酸合酶:对衬底绑定和催化的影响。
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Garrido-Franco M,标签B, Huber R,克劳森T
Enzyme-ligand复合物的吡哆醇5 '磷酸合酶:对衬底绑定和催化的影响。
J杂志。2002年8月23日,321(4):601 - 12所示。
- PubMed ID
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12206776 (在PubMed]
- 文摘
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5 '磷酸吡哆醇(PNP)合酶是酶的新创生物合成维生素B(6)催化1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate和1-amino-acetone-3-phosphate之间复杂的环化反应。这里我们提出四个PNP型合酶复合物的晶体结构与基板和底物类似物。虽然整体的折叠酶复合体是守恒的,特征调整活性部位的观察。允许互补结构信息,我们提出了一个详细的反应机理。底物的观察到的绑定模式表明第一反应中间体,席夫碱结合,就形成了。最重要的机械特性的存在两个phosphate-binding网站独特的亲和力和水的存在中继系统释放水分子的反应。此外,复合物提供合理化的基础上得到的灵活循环过渡位于TIM-barrel c端一侧的。绑定两个底物分子的活性部位似乎是一个先决条件触发这种转变。高度保守的力学上重要的残留PNP型合酶家族意味着相似的活性部位组织和所有家庭成员的反应机制。由于独家PNP型合酶在真细菌的一个子集,包括一些知名的病原体,并因其杰出的生理重要性对于这些生物,这种酶似乎是一种很有前途的新型抗菌药物设计的目标。