新反应crotonase总科:结构methylmalonyl辅酶a脱羧酶的大肠杆菌。
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本宁MM,哈勒T, Gerlt是的,霍尔顿嗯
新反应crotonase总科:结构methylmalonyl辅酶a脱羧酶的大肠杆菌。
生物化学。2000年4月25日,39 (16):4630 - 9。
- PubMed ID
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10769118 (在PubMed]
- 文摘
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methylmalonyl辅酶a脱羧酶的分子结构(MMCD)的一个新定义的成员crotonase总科由大肠杆菌基因组编码,解决了x射线晶体分析的分辨率为1.85 2.7 unliganded形式和解决一个复杂的惰性硫醚模拟methylmalonyl - CoA。像其他两个结构特征的成员crotonase总科(crotonase和dienoyl辅酶a异构酶),MMCD是六聚物(三聚体)与每一个多肽链组成的两个结构图案。更大的n端结构域包含活性部位,而小c端主题是α螺旋,主要涉及在三聚。与其他的成员crotonase总科,然而,c端主题是折叠回n端结构域,这样每个活动网站是完全包含在一个单元。硫醚羧酸盐组的模拟methylmalonyl - CoA是氢连着peptidic NH群g的110和66的咪唑环。从建模研究,似乎酪氨酸140是定位在活性部位参与定向脱羧反应的羧基methylmalonyl - CoA,正交平面上的羰基硫代酸酯。令人惊讶的是,虽然113年MMCD包含Glu活性部位,这是同源一般酸/碱Glu 144年crotonase的活性部位,其侧链的羧酸盐氢连着Arg 86,这表明它不直接参与催化。新星座的假定的官能团活性部位的观察MMCD强调功能在这个家族的多样性。