解决方案的结构复杂的干酪乳杆菌与甲氨蝶呤二氢叶酸还原酶。
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Gargaro AR, Soteriou Frenkiel助教,鲍尔CJ, Birdsall B, Polshakov VI, Barsukov,罗伯茨GC,捐助J
解决方案的结构复杂的干酪乳杆菌与甲氨蝶呤二氢叶酸还原酶。
J杂志。1998年3月20日,277 (1):119 - 34。
- PubMed ID
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9514736 (在PubMed]
- 文摘
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我们已经确定的三维解决方案结构复杂的干酪乳杆菌二氢叶酸还原酶(18.3 kDa, 162氨基酸残基)形成与抗癌药物甲氨蝶呤使用2531距离,361二面角和48个氢键限制获得多维核磁共振光谱分析。模拟退火的计算产生了21个结构完全符合约束条件的家庭。有四个阿尔法螺旋结构和八beta-strands与另外两个地区,包括残留11至14岁和126年到127年,还在β褶板的方式相互作用。甲氨蝶呤绑定网站很好定义和围绕其提高谷氨酸一半的结构包括限制反映出先前决定特定的谷氨酸alpha-carboxylate集团之间的相互作用与Arg57和His28 gamma-carboxylate组。整个折叠二进制复杂的解决方案非常类似于观察x射线研究三元复杂的l .干酪乳杆菌与甲氨蝶呤和NADPH形成二氢叶酸还原酶(二元和三元复合物的结构骨架原子的均方根差0.97)。因此没有主要构象变化发生在NADPH结合二进制复杂。二进制复杂,循环包括残留9 - 23的哪一部分活跃的网站已被证明是“封闭”构象所定义的m·r·萨瓦亚& j .德国人谁认为相应的循环复合物晶体结构的二氢叶酸还原酶从几个生物。因此NADPH的缺席不会导致循环的“闭塞”的形式如水晶的研究一些其他二氢叶酸还原酶的辅酶。一些地区二元结构的复杂形成互动网站NADPH的定义良好的不如其他地区。然而,一般而言,NADPH结合位点似乎基本上成品在二进制复杂。这可能导致更严格的约束力的辅酶的甲氨蝶呤的存在。