整合结构、生物信息学和酶学发现功能:BioH,羧酸酯酶的大肠杆菌。
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拉斯科夫斯基Sanishvili R,雅库宁房颤,风湿性关节炎,Skarina T, Evdokimova E, Doherty-Kirby, Lajoie GA,桑顿JM,阿罗史密斯CH, sachenko, Joachimiak,爱德华兹
整合结构、生物信息学和酶学发现功能:BioH,羧酸酯酶的大肠杆菌。
生物化学杂志。2003年7月11日;278 (28):26039 - 45。2003年5月5日Epub。
- PubMed ID
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12732651 (在PubMed]
- 文摘
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结构蛋白质组学项目生成三维结构的小说,但一个个蛋白质以越来越快的速度。然而,单独结构通常是不足以推导出特定的生化功能的蛋白质。我们决定蛋白质的功能使用相结合的战略结构和生物信息学数据与平行实验筛选酶活性。BioH参与生物素生物合成在大肠杆菌和没有已知的生化功能。1.7 BioH决心的晶体结构解析。一个自动化的过程被用来比较BioH的结构和结构模板从不同的酶活性位点。此屏幕上发现了一个催化三分子(Ser82 His235, Asp207)配置类似的水解酶的催化三分子。分析BioH水解酶化验显示面板的羧酸酯酶活性与偏爱短酰基链基板。结构生物信息学与实验的结合使用屏幕检测酶活性可以大大提高的速度函数确定结构。