肽deformylase家族内部的结构关系。证据保存活性部位的架构包括三个守恒的主题和一个金属离子。
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Meinnel T, Lazennec C, Villoing年代,Blanquet年代
肽deformylase家族内部的结构关系。证据保存活性部位的架构包括三个守恒的主题和一个金属离子。
J杂志。1997年4月4日,267 (3):749 - 61。
- PubMed ID
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9126850 (在PubMed]
- 文摘
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栖热菌属酸奶肽deformylase为特征。其酶学性质以及组织领域证明了分享与大肠杆菌的酶密切的相似之处,尽管一些序列的身份。除了HEXXH签名序列的锌metalloprotease家庭,另一个短的严格守恒的氨基酸是注意到,EGCLS,半胱氨酸的对应第三锌配位体。deformylase大肠杆菌的基因定点突变体的研究表明,这个延伸的残留物是至关重要的结构和/或催化效率的活跃的酶。提到的序列都是用作标记肽deformylase家族的蛋白质序列数据库。七个序列来自流感嗜血杆菌,Lactococcus lactis,芽孢杆菌stearothermophilus,支原体,支原体肺炎支原体,芽孢杆菌subtilus和集胞藻属sp.可以被识别。产品的描述开放阅读框的b stearothermophilus证实,它实际上与肽deformylase属性类似的大肠杆菌酶。对齐的九肽deformylase序列表明,除了上面的两个序列,只有三分之一,GXGXAAXQ,严格守恒的。这个主题也位于活跃的站点根据大肠杆菌酶的三维结构。定点变异的大肠杆菌肽deformylase显示相应的残留的参与对维持一个活跃的和稳定的酶。 Altogether, these data allow us to propose that the three identified conserved motifs of peptide deformylases build up the active site around a metal ion. Finally, an analysis of the location of the other conserved residues, in particular of the hydrophobic ones, was performed using the three-dimensional model of the E. coli enzyme. This enables us to suggest that all bacterial peptide deformylases adopt a constant overall tertiary structure.