解决方案结构和基础扰动研究揭示出小说的烷基化模式基本识别3-methyladenine DNA糖基化酶I。
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曹C, Kwon K,江YL Drohat AC, Stivers称JT
解决方案结构和基础扰动研究揭示出小说的烷基化模式基本识别3-methyladenine DNA糖基化酶I。
J生物化学杂志。2003年11月28日,278 (48):48012 - 20。Epub 2003年9月16日。
- PubMed ID
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13129925 (在PubMed]
- 文摘
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具体识别DNA修复机制在DNA糖基化酶,去除阳离子alkylpurine基地不太理解的部分原因是这些酶的缺乏结构同源的基地。在这里,我们报告的解决方案结构3-methyladenine DNA糖基化酶与其3-methyladenine我(标签)的复杂(3-MeA)同源基地,和我们使用化学微扰基地与诱变相结合的酶来评估氢键的作用和pi-cation交互在烷基化基础识别DNA修复酶。我们发现标签使用氢和杂原子成键固定在底座上,范德瓦耳斯相互作用3-Me集团和介子堆传统保守Trp侧链在阳离子选择性地结合中性3-MeA形式的基础。正常基腺嘌呤的歧视绑定来自3 -甲基组的直接感知,导致诱导契合构象变化吞没定义的基础在一个盒子里五芳香族侧链。这些发现表明,基本不涉及特定的识别标签pi-cation强相互作用,并提出一种新型烷基化基础识别和移除的机制。