配合物晶体的链霉亲和素与肽配体含有hp序列肽的pKa组氨酸小于3.0。
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Katz英航,卡斯RT
配合物晶体的链霉亲和素与肽配体含有hp序列肽的pKa组氨酸小于3.0。
生物化学杂志。1997年5月16日;272 (20):13220 - 8。
- PubMed ID
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9148939 (在PubMed]
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pH值依赖性亲和力的链霉亲和素包含hp序列的线性和环肽配体的发现了噬菌体展示测定等离子体共振测量。在pH值从3.0到9.0,为Ac-AEFSHPQNTIEGRK-NH2 Kd值,cyclo-Ac-AE CHPQGPPC IEGRK-NH2,和cyclo-Ac-AE CHPQFC IEGRK-NH2,由竞争决定,这些三轮车- [5-S-valeramide-HPQGPPC] K-NH2直接测定平衡关联测量。配体的Kd值平均增加3.0 + / - 0.8倍每减少酸碱单元之间大约4.5和pH值大约6.3。下面的pH值大约4.5 Kd值较小的增加,以上变得相对pH-independent pH值大约6.3 Kd值。我们确定配合物的晶体结构链霉亲和素与三轮车5-S-valeramide-HPQGPPC K-NH2 pH值1.5,2.5,3.0,和3.5,cyclo-Ac - [CHPQFC] - nh2 pH值2.0,3.0,3.6,4.2,4.8,和11.8,cyclo-Ac - [CHPQGPPC] - nh2在pH值为2.5,2.9和3.7,与FSHPQNT pH值4.0和结构相比,与之前在其他pH值确定。在pH值从3.0到11.8,他肽侧链的电子密度强,平坦的和良好定义的。Ndelta1原子之间的氢键的他和氨基肽Gln组表示绑定肽的晶体在pH > / = 3.0卸货。通过确定选择在两个不同的空间组织结构,I222两个结晶学不一样配体与一个网站,网站和I4122我们表明,pH值大约3.0以下,结合肽的pKa晶体中他受到水晶填料的相互作用。Ndelta1His-NGln氢键的存在随着pH值的依赖性肽的肽亲和力建议去质子化他需要高亲和力结合HPQ-containing肽链霉亲和素晶体和解决方案。