结构性基础精通酶的催化机理:orotidine 5 '一磷酸脱羧酶。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
哈里斯P,纳瓦罗Poulsen JC,詹森KF,拉森
结构性基础精通酶的催化机理:orotidine 5 '一磷酸脱羧酶。
生物化学。2000年4月18日,39 (15):4217 - 24。
- PubMed ID
-
10757968 (在PubMed]
- 文摘
-
Orotidine 5 '一磷酸脱羧酶(ODCase)能够催化Orotidine进行脱羧反应的酶5 '一磷酸,从头合成的最后一步一磷酸尿苷5”。ODCase非常精通酶[Radzicka,。,沃尔芬登,r(1995) 267年科学,90 - 93],提高反应速率10倍(17)。实现这种能力一直是神秘的,因为它没有金属离子或代数余子式。这里我们提出一个分辨率2.5结构ODCase包裹着抑制剂1 - (5 ' -phospho-beta-D-ribofuranosyl)巴比妥酸。它显示了一个密集的二聚体由两个α/ beta-barrels共有两个活跃的网站。的方向orotate衬底的一部分是明确地推导出的结构,和先前提出的催化机制涉及O2或O4的质子化作用可以排除。邻近的OMP羧基Asp71似乎是工具性的OMP进行脱羧反应的酶,通过电荷斥力或非常短的平炉的形成O氢键之间的两个羧酸盐组。