利用液相色谱-串联质谱技术对铜绿假单胞菌膜亚蛋白质组进行全球分析。
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Blonder J, Goshe MB, Xiao W, Camp DG 2, Wingerd M, Davis RW, Smith RD
利用液相色谱-串联质谱技术对铜绿假单胞菌膜亚蛋白质组进行全球分析。
中国生物医学工程学报(英文版);2004(3):434-44。
- PubMed ID
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15253424 (PubMed视图］
- 摘要
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铜绿假单胞菌是人类最重要的机会性细菌病原体之一，可导致囊性纤维化、艾滋病、严重烧伤、器官移植或癌症患者感染和过早死亡。采用在线液相色谱-串联质谱技术对铜绿假单胞菌膜亚蛋白质组进行了大规模的蛋白质组学分析。同时，一种亲和标记技术，使用碘乙酰- peo生物素标记含半胱氨酸的蛋白质，允许富集和检测低丰度的膜蛋白。应用这些方法鉴定出786种蛋白。共有333个蛋白(42%)至少有一个跨膜结构域(范围从1到14)，195个蛋白根据其阳性的GRAVY值(范围从0.01到1.32)被分类为疏水蛋白。最终鉴定出了与适应和抗生素耐药性有关的关键内膜和外膜整合蛋白，包括53%的预测opr型孔蛋白(外整合膜蛋白)和mexA-mexB-oprM跨膜蛋白复合物的所有组分。这项工作代表了铜绿假单胞菌和原核生物膜亚蛋白质组的最全面的蛋白质组学分析之一。