高分辨率x射线结构isoaspartyl二肽酶的大肠杆菌。
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Thoden JB, Marti-Arbona R, Raushel调频,霍尔顿嗯
高分辨率x射线结构isoaspartyl二肽酶的大肠杆菌。
生物化学,2003年5月6日,42 (17):4874 - 82。
- PubMed ID
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12718528 (在PubMed]
- 文摘
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Isoaspartyl二肽酶大肠杆菌功能的蛋白质水解的催化降解beta-L-isoaspartyl联系在二肽。的最佳基质酶iso-Asp-Leu报道到目前为止。在这里,我们报告的x射线分析酶在静息状态和包裹着天冬氨酸1.65和2.1分辨率,分别。酶的四级结构是octameric,可以恰当地描述为一个四聚物二聚体。每个亚基折叠成两个不同的领域:包含八链的氨基端地区混合β褶板和c端为主的主题(βα)(8)桶。双核的锌中心位于每个亚基的c端一端(βα)(8)桶。配体双核的金属中心包括他68年、70年、201年、230年和285年Asp。两个锌是由羧酸盐桥接赖氨酸残留物(赖氨酸162)和溶剂分子,最有可能的一个氢氧根离子。反应的产物,天冬氨酸酶结合,取代过渡性溶剂的侧链官能团。从这个调查提出,酶的反应机理通过四面体中间,桥接溶剂袭击的再保险的羰基碳易裂开的肽键。 This structural analysis confirms the placement of isoaspartyl dipeptidase into the urease-related amidohydrolase superfamily.