NMR侧链作业和解决方案结构的酶IIBcellobiose phosphoenolpyruvate-dependent磷酸转移酶的大肠杆菌体系。
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Ab E, Schuurman-Wolters G,锐志J,摩尔庄园MH, Dijkstra算法K,州GT Scheek RM,罗毕拉德
NMR侧链作业和解决方案结构的酶IIBcellobiose phosphoenolpyruvate-dependent磷酸转移酶的大肠杆菌体系。
蛋白质科学。1997年2月,6 (2):304 - 14。
- PubMed ID
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9041631 (在PubMed]
- 文摘
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赋值的侧链核磁共振三维解决方案结构的共振和决心的c10突变酶IIBcellobiose (IIBcel) phosphoenolpyruvate-dependent磷酸转移酶系统的大肠杆菌。的侧链共振被分配几乎完全使用各种主要异核核磁共振实验,包括HCCH-TOCSY HCCH-COSY,和COCCH-TOCSY实验以及CBCACOHA CBCA NH(有限公司),和HBHA (CBCA) (CO) NH实验。为了获得三维结构,一个数据收集从15 n-noesy-hsqc 13 c-hsqc-noesy, 2 d的一个实验。距离限制源自这一数据被用于距离几何计算分子动力学和模拟退火协议紧随其后。在迭代过程中,附加一个作业是由计算结构和新结构计算。最后一组的结构,计算出大约2000个明确的和模棱两可的距离限制,α的均方根偏差在1.1 C原子。IIBcel由四个链平行β褶板,2134年的顺序。2和3的单在阿尔法螺旋。残留物,在野生型半胱氨酸酶,催化循环中磷酸化,位于第一beta-strand结束。提出了一种循环参与phosphoryl-group遵循半胱氨酸的绑定。 The loop appears to be disordered in the unphosphorylated state.