重新定义第四纪的角色转变杆菌stearothermophilus磷酸果糖激酶。
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Mosser R, Reddy MC, Bruning JB Sacchettini JC,莱因哈特GD
重新定义第四纪的角色转变杆菌stearothermophilus磷酸果糖激酶。
生物化学。2013年8月13日,52 (32):5421 - 9。doi: 10.1021 / bi4002503。Epub 2013年7月31日。
- PubMed ID
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23859543 (在PubMed]
- 文摘
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芽孢杆菌stearothermophilus磷酸果糖激酶(BsPFK)是一个homotetramer变构抑制着的磷酸烯醇丙酮酸(PEP),结合在一个dimer-dimer接口。衬底,果糖6-phosphate (Fru-6-P),结合其他dimer-dimer界面。埃文斯等人发现抑制剂(phosphoglycolate)约束的结构,相对于野生型的结构BsPFK基质和激活绑定,展品的7度旋转substrate-binding接口,称为第四纪[Schirmer T的转变。beplayapp自然,埃文斯,p . r .(1990) 343年,140 - 145]。我们报告的变体D12A BsPFK展品100倍增加了PEP亲和力,Fru-6-P 50倍降低它的亲和力,但抑制耦合与野生型的。apo和PEP-bound形式的晶体结构D12A BsPFK已经确定(蛋白质数据库条目4 i36和4 i7e,分别),都表明了结构类似于inhibitor-bound野生型的结构。D12并不直接与底物或抑制剂结合,坐落在substrate-binding接口。保守之间的氢键D12和T156形式substrate-binding subunit-subunit BsPFK substrate-bound形式的接口。T156A变体BsPFK,与野生型相比,显示了一个30倍增加PEP亲和力,Fru-6-P亲和力下降的统计,估计耦合也约等于野生型。另外,T156A BsPFK晶体结构绑定到PEP报告(蛋白质数据银行条目4 i4i),它展示了结构类似于D12A BsPFK inhibitor-bound野生型的结构。结果表明,第四纪转变的主要作用可能影响配体结合而不是导致斜交变构抑制本身。