高分辨率x射线结构UDP-galactose 4-epimerase包裹着UDP-phenol。
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Thoden JB,弗雷PA,霍尔顿嗯
高分辨率x射线结构UDP-galactose 4-epimerase包裹着UDP-phenol。
蛋白质科学。1996年11月,5 (11):2149 - 61。
- PubMed ID
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8931134 (在PubMed]
- 文摘
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从大肠杆菌催化UDP-galactose 4-epimerase UDP-glucose和UDP-galactose的互变现象。近年来,酶被密集的调查的主题部分是由于它能促进nonstereospecific氢化物转移beta-NADH和4-keto hexopyranose中间。第一个差向异构酶的大肠杆菌分子模型解决2.5决议与晶体生长在底物类似物的存在,UDP-phenol(鲍尔AJ, Rayment我,弗雷PA,霍尔顿嗯,1992年,蛋白质结构功能麝猫12:372 - 381)。当时有顾虑,抑制剂没有充分模仿真正的衬底的糖一半。在这里,我们描述了高分辨率x射线晶体结构的三元复杂UDP-galactose 4-epimerase NADH和UDP-phenol。1.8分辨率的模型细化最终整体r因子为18.6%。这种高分辨率结构分析表明,最初的担忧是毫无根据的,事实上,UDP-phenol UDP-glucose绑定类似。二核苷酸的甲酰胺组,在两个子单元,是流离失所的显著的飞机烟酰胺环通过氢键相互作用爵士124年和149年酪氨酸。UDP-galactose 4-epimerase属于一个家庭的酶称为短链脱氢酶,含有一个特征Tyr-Lys夫妇认为是重要的催化作用。这里给出的差向异构酶/ NADH / UDP-phenol模型代表一个定义良好的三元复杂的蛋白质和这个家庭,因此,提供了重要的信息关于可能的角色Tyr-Lys夫妇的反应机理。