T4噬菌体beta-glucosyltransferase:衬底绑定和提出了催化机理。
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莫雷拉年代,Imberty Aschke-Sonnenborn U,鲁格W, Freemont PS
T4噬菌体beta-glucosyltransferase:衬底绑定和提出了催化机理。
J杂志。1999年9月24日,292 (3):717 - 30。
- PubMed ID
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10497034 (在PubMed]
- 文摘
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beta-Glucosyltransferase(英国达人)是一个DNA-modifying T4噬菌体编码的酶的催化作用葡萄糖从尿苷(相关)的转移diphosphoglucose (UDP-Glc) 5-hydroxymethylcytosine (5-HMC)双链DNA。T4噬菌体的glucosylation DNA噬菌体基因的一部分保护系统旨在主机核酸酶。我们之前报道的第一三维结构踏进决定从包含UDP-Glc晶体生长在硫酸铵。在这之前的结构中,我们没有观察到电子密度的相关UDP-Glc还是两大表面循环的一部分地区(残留68 - 76和109 - 122)。这里我们报告两个进一步踏进co-crystal结构,在UDP产品(我)和供体基质UDP-Glc (II)形式,分别。形式我在硫酸铵晶体生长和结构已经确定分辨率1.88 (R因子19.1%)。形成第二晶体生长在聚乙二醇4000和2.3结构解决了分辨率(R因子19.8%)。表单我结构是我们以前的英国达人UDP-Glc同晶型结构。第二形式结构,然而,允许我们模型两个失踪的表面循环区域,从而提供了第一个完整的英国达人的结构描述。在这个低盐晶体形式中,我们没有看到电子密度相关的一部分从UDP-Glc类似于以前的观测。 Biochemical data however, shows that BGT can cleave UDP-Glc in the absence of DNA acceptor, which probably accounts for the absence of Glc in our UDP-Glc substrate structures. The complete BGT structure now provides a basis for detailed modelling of a BGT HMC-DNA ternary complex. By using the structural similarity between the catalytic core of glycogen phosphorylase (GP) and BGT, we have modelled the position of the Glc moiety in UDP-Glc. From these two models, we propose a catalytic mechanism for BGT and identify residues involved in both DNA binding and in stabilizing a "flipped-out" 5-HMC nucleotide.