人类NUDT9的晶体结构和突变分析。
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沈BW, Perraud AL Scharenberg,斯托达德提单
人类NUDT9的晶体结构和突变分析。
J杂志。2003年9月12日,332 (2):385 - 98。
- PubMed ID
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12948489 (在PubMed]
- 文摘
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人类ADP-ribose焦磷酸酶NUDT9属于Nudix化水解酶的总科异化细胞中的潜在的有毒化合物。酶水解ADP-ribose (ADPR) AMP和核糖5 '磷酸。NUDT9股票39%序列身份的c端胞质域ADPR-gated钙通道TRPM2,展品低,但特定的酶活性。我们确定晶体结构的NUDT9存在和没有反应的产品5 '磷酸核糖。这些结构的基础上,比较细菌同系物,基质复杂的模型。的结构和活动双点突变(R F E (229) (230) (231) R(229)我(230)L(231)),模仿Nudix签名的离子通道领域,确定。最后,一对额外的突变的活动构造比较野生型酶。第一个对应于最小Nudix领域缺少一个n端结构域和c端尾;第二个破坏一般基地的两个潜在的活性部位。NUDT9包含一个n端结构域小说褶皱和催化c端Nudix域。 Unlike its closest functional homologue (homodimeric Escherichia coli ADPRase), it is active as a monomer, and the substrate is bound in a cleft between the domains. The structure of the RIL mutant provides structural basis for the reduced activity of the TRPM2 ion channel. The conformation and binding interactions of ADPR substrate are predicted to differ from those observed for E.coli ADPRase; mutation of structurally aligned acidic residues in their active sites produce significantly different effects on catalytic efficiency, indicating that their reaction pathways and mechanisms may have diverged.