进化关系chlorocatechol蔽光高分解代谢的酶从红球菌属1 cp和变形菌门的同行:序列散度和功能融合。
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Eulberg D, Kourbatova EM Golovleva洛杉矶,Schlomann M
进化关系chlorocatechol蔽光高分解代谢的酶从红球菌属1 cp和变形菌门的同行:序列散度和功能融合。
J Bacteriol。1998年3月,180 (5):1082 - 94。
- PubMed ID
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9495745 (在PubMed]
- 文摘
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生化muconate调查和chloromuconate cycloisomerases从chlorophenol-utilizing蔽光高应变红球菌属(erythropolis) 1 cp曾表示,这一毒株chlorocatechol分解代谢途径可能有独立开发从相应的变形菌门的途径。为了验证这个假设,我们的chlorocatechol降解基因簇的克隆菌株1 cp利用PCR引物来自N末端序列和肽的纯化chlorocatechol 1, 2-dioxygenase和chloromuconate cycloisomerase。克隆测序的透露,他们组成的不同部分相同的基因簇中五个开放阅读框架已确定。clcB基因为chloromuconate cycloisomerase转录发散思维从一个基因编码一个LysR-type监管蛋白质,假定ClcR。下游clcR但分开了222个基点,我们发现clcA clcD基因,可以明确地分配给chlorocatechol 1, 2-dioxygenase dienelactone水解酶。一个基因编码一个maleylacetate还原酶不能被探测到。相反,该产品由第五个开放阅读框编码是同源IS1031和Tn4811 transposition-related蛋白质。序列比较ClcA ClcB其他1,2-dioxygenases cycloisomerases,分别清晰地表明,chlorocatechol分解酶1 r .蔽光的cp系统树图中代表不同的分支比proteobacterial同行。因此,虽然序列分化、功能适应高效chlorocatechol独立代谢发生变形菌门和革兰氏阳性细菌,也就是说,通过功能趋同进化。