1.7葡萄球菌核酸酶精制的晶体结构解析。
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海因斯TR,福克斯RO
1.7葡萄球菌核酸酶精制的晶体结构解析。
蛋白质。1991;10 (2):92 - 105。
- PubMed ID
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1896431 (在PubMed]
- 文摘
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葡萄球菌核酸酶的晶体结构与最后一个决心分辨率1.7 r因子16.2%使用立体化学抑制Hendrickson-Konnert最小二乘优化。构象变化的结构揭示了一个数量相对于结构的三元复杂的葡萄球菌核酸酶1,2绑定deoxythymidine-3 ', 5 '磷酸氢盐和Ca2 +。酪氨酸- 113和酪氨酸- 115,包对核酸酶的核苷酸基础复杂,旋转向外创造一个更加开放的口袋里没有核苷酸有约束力。Ca2 +的侧链配体Asp-21 Glu-43一样Asp-40转变,提出一般基地5 '磷酸二酯键的水解。一些催化部位变化的意义是不确定的,由于入侵相关的对称赖氨酸- 70侧链Asp-21和Glu-43氢键。一个灵活的位置环围绕残渣50改变,很可能由于构象变化从Ca2 +网站传播。Arg-35的侧链,赖氨酸- 84,酪氨酸- 85,- 87和参数,氢键的3 ' - 5 '磷酸核苷酸的核酸酶复杂,不变的构象,包装与相邻的蛋白质侧链相互作用足以解决几何没有配体。本文提供的核酸酶结构,结合立体化学抑制核酸酶复杂结构的细化,1.65提供了一个丰富的结构信息数量的增加使用葡萄球菌核酸酶作为模型系统研究蛋白质的结构和功能。