大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶的晶体结构:与人类酶比较揭示出了一个守恒的拓扑。
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周毛C,库克WJ, M, Koszalka GW, Krenitsky助教,Ealick SE
大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶的晶体结构:与人类酶比较揭示出了一个守恒的拓扑。
结构。1997年10月15日,5 (10):1373 - 83。
- PubMed ID
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9351810 (在PubMed]
- 文摘
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背景:嘌呤核苷磷酸化酶(PNP)大肠杆菌是一种hexameric酶,催化可逆磷酸解6-amino和6-oxopurine(2)脱氧核糖核苷的游离碱和(2 '脱氧)ribose-1-phosphate。相比之下,人类和牛pnp型三聚物的,只接受6-oxopurine核苷为底物。这两种酶的特异性的差异已经利用基因疗法治疗中某些高活性化合物是由大肠杆菌裂解PNP型而不是人类的酶。和三聚物的hexameric pnp型没有在氨基酸序列相似性,尽管他们催化相同的化学反应。结构比较活跃的站点的哺乳动物和大肠杆菌PNP型的设计提供一种改进的依据潜在高活性化合物特定大肠杆菌PNP型。结果:大肠杆菌PNP型的晶体结构为2.0一项决议,显示整个单元拓扑和活性部位的位置在子单元类似于子单元从人类PNP型和尿苷磷酸化酶大肠杆菌。然而,即使的整体几何PNP型大肠杆菌活性部位类似于人类PNP型活性位点残基及亚基相互作用是截然不同。在大肠杆菌PNP型,嘌呤ribose-binding网站一般是疏水性,虽然可能从隔壁单元组氨酸残基形成氢键的羟基糖。phosphate-binding站点可能由两个主链的氮原子和三个精氨酸残基。此外,活跃的站点hexameric PNP型比三聚物的PNP容易得多。 CONCLUSIONS: The structures of human and E. coli PNP define two possible classes of nucleoside phosphorylase, and help to explain the differences in specificity and efficiency between trimeric and hexameric PNPs. This structural data may be useful in designing prodrugs that can be activated by E. coli PNP but not the human enzyme.