识别c反应蛋白的调节子使用体外和体内转录剖析。
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郑D, Constantinidou C, Hobman杰,Minchin SD
识别c反应蛋白的调节子使用体外和体内转录剖析。
核酸研究》2004年11月1日,32 (19):5874 - 93。打印2004。
- PubMed ID
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15520470 (在PubMed]
- 文摘
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大肠杆菌环腺苷酸受体蛋白(CRP)是一个全球监管机构,从100多个启动子控制转录起始绑定到一个特定的DNA序列同源的推动者。许多基因c反应蛋白调节子的预测仅仅基于在基因启动子dna结合网站的存在。在这项研究中,我们利用一个新开发的技术,径流转录/微阵列分析(罗马)定义CRP-regulated推动者。使用罗马,我们确认了176个操纵子,被c反应蛋白在体外激活和16个压抑的操纵子。使用积极的控制c反应蛋白突变体在不同的地区,我们可以分类不同的启动子到类或类II / III。共有104个操纵子预测包含二级CRP-binding网站。压抑的操纵子的序列分析CRP显示不同的c反应蛋白抑制机制。相比之下,体内转录资料未能识别大多数CRP-dependent监管,因为监管网络的复杂性。分析这些操纵子支持假设c反应蛋白不仅是监管机构所需的基因以外的糖的分解代谢葡萄糖,而且调节大量其他基因的表达在大肠杆菌。罗马透露152年迄今未知的CRP调节子。