违背自然的氨基酸识别的结构基础的工程氨酰合成酶基因编码的扩张。
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小林T, Sakamoto K, Takimura T,关根身上R,凯莉VP, Kamata K,西村年代,Yokoyama年代
违背自然的氨基酸识别的结构基础的工程氨酰合成酶基因编码的扩张。
《美国国家科学院刊S a . 2005年2月1,102 (5):1366 - 71。2005年1月25日Epub。
- PubMed ID
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15671170 (在PubMed]
- 文摘
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遗传密码在真核系统中已经扩展的工程大肠杆菌tyrosyl-tRNA合成酶(TyrRS) Y37V Q195C突变(37 v195c),专门识别3-iodo-L-tyrosine而不是酪氨酸。在目前的研究中,我们确定了3-iodo-L-tyrosine -和L-tyrosine-bound结构的37 v195c大肠杆菌的突变TyrRS催化域为2.0 a分辨率。Val-37 gamma-methyl组和半胱氨酸- 195的硫原子使范德华接触3-iodo-L-tyrosine的碘原子。Val-37和半胱氨酸- 195侧链刚性固定的邻近的残留物形成疏水核心TyrRS。两个突变的主要角色3-iodo-L-tyrosine-selective识别不同的氨酰化反应的第一步(氨基酸活化步骤):Y37V突变消除了致命的空间斥力与碘原子,和作品点出Q195C突变降低了酪氨酸。37 v195c的结构突变TyrRS L-tyrosyladenylate模拟的复合体也解决,表明3-iodo-L-tyrosine和酪氨酸侧链也同样歧视在第二步(氨酰基转移步骤)。这些结果表明,氨基结合口袋的37 v195c突变为特定3-iodo-L-tyrosine识别进行了优化。