比较野生型的结构和N313T大肠杆菌甘油醛3 -磷酸脱氢酶的突变:暗示NAD绑定和协同。
文章的细节
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引用
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Duee E, Olivier-Deyris L, Fanchon E,科C, Branlant G, Dideberg O
比较野生型的结构和N313T大肠杆菌甘油醛3 -磷酸脱氢酶的突变:暗示NAD绑定和协同。
J杂志。1996年4月12日,257 (4):814 - 38。
- PubMed ID
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8636984 (在PubMed]
- 文摘
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野生型的晶体结构和N313T突变甘油醛3 -磷酸脱氢酶的大肠杆菌在NAD的存在决定1.8埃和2.17埃,分别。四聚物的单体的结构和对其他GAPDHs所观察到的类似。疏水性的详尽分析集群和氢键网络GAPDHs解释序列的高度保护。N313T突变的结构效应的变化(φ,psi)角附近的残留Asn236 Val237,而周围的结构突变残渣保持不变。详细比较了野生型和突变大肠杆菌GAPDH N313T apo和整体形式的芽孢杆菌stearothermophilus GAPDH与apo - - >进行整体转型。无偏的大约60残留的C原子(α)保持在beplayapp相同的相对位置的不同形式四聚物,被定义为四聚物的“核心”充当固定支架的结构重组发生在apo - - >整体转型。这个核心本质上包括从β折叠形成beta-strands O-P和q r接口,特别是链beta1熊催化His176残留。在apo - - >整体转型,二聚体O-P旋转分子p轴+ 1度左右,和二聚体或约1度。beplayapp进一步旋转NAD绑定域相对于催化域分子对称性的关系进行了讨论。可能影响NAD绑定协同四聚物突变的核心是252年以残渣。 The presence of a conserved hydrophilic patch embedded in the hydrophobic O-P interface is highlighted. A mechanism for substrate binding, different from those currently proposed, is described where the hydroxyl group of the substrate C(2) atom is hydrogen bonded to Cys149N.