筛查的人类SNP数据库标识重新编码网站A-to-I RNA编辑。
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Gommans WM, Tatalias NE您CP Dupuis D, Vendetti N, L,史密斯Kaushal R,马斯河
筛查的人类SNP数据库标识重新编码网站A-to-I RNA编辑。
RNA。2008年10月,14日(10):2074 - 85。doi: 10.1261 / rna.816908。Epub 2008年9月4。
- PubMed ID
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18772245 (在PubMed]
- 文摘
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单核苷酸多态性(SNPs) DNA序列变异可以影响基因的表达或功能。因此,他们可能会导致个体之间的表型差异,如对疾病的易感性、应对药物和疾病进展。数以百万计的单核苷酸多态性被映射在人类基因组遗传变异研究提供了丰富的资源。Adenosine-to-inosine RNA编辑也会导致生产的RNA和蛋白质序列变异,但它作用于主基因的转录水平。序列变化由于RNA编辑可能misannotated snp在单纯依赖表达序列数据而不是基因材料。在这项研究中,我们筛选了人类SNP数据库的潜在情况下A-to-I RNA编辑导致氨基酸编码蛋白质的变化。我们的搜索策略五个分子特性适用于分数候选人的网站。它标识所有先前的编辑中SNP数据库并成功地揭示小说,善意的腺苷脱氨基作用编辑的目标。我们的方法设置为有效和全面的全基因组屏幕A-to-I编辑目标。