独特的疏水活性部位附近的集群有助于borrelidin抑制的差异threonyl-tRNA合成酶。

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阮B, Bovee ML,萨赫M, Stathopoulos C, Poralla K, Francklyn CS, Soll后D

独特的疏水活性部位附近的集群有助于borrelidin抑制的差异threonyl-tRNA合成酶。

J生物化学杂志。2005年1月7日,280 (1):571 - 7。Epub 2004年10月26日。

PubMed ID

15507440 (在PubMed

]

文摘

Borrelidin,化合物具有抗微生物和抗血管生成的属性,是一种已知的抑制剂的细菌和eukaryal threonyl-tRNA合成酶(ThrRS)。borrelidin的抑制机制还不是很清楚。古生菌含有古细菌和细菌类型ThrRS酶的序列。我们探索了导致的ThrRSs的borrelidin抑制。从硫化叶菌的活动ThrRS solfataricus Halobacterium sp。NRC-1被borrelidin抑制,而ThrRS酶从Methanocaldococcus jannaschii和Archaeoglobus fulgidus没有。在大肠杆菌ThrRS, borrelidin绑定诱导一个构象的变化,和苏氨酸不是ATP-PP激活如图所示的(我)交换和瞬态动力学分析测量内在色氨酸荧光变化。这些分析进一步表明,borrelidin是大肠杆菌的非竞争性紧密绑定抑制剂ThrRS苏氨酸和ATP。borrelidin-resistant突变体的基因选择显示borrelidin结合疏水区域(刺- 307,- 309,半胱氨酸- 334 pro - 335,亮氨酸- 489,亮氨酸- 493)的锌离子在活性部位近端ThrRS大肠杆菌。变异残渣亮氨酸- 489 - - > Trp降低疏水的空间集群和增加了1500倍的K(我)值从6 microm 4海里。ThrRS序列的一致性表明,这个集群是守恒的在大多数生物体除了一些古菌(如m . jannaschii fulgidus)和一些病原体(例如幽门螺杆菌)。 This study illustrates how one class of natural product inhibitors affects aminoacyl-tRNA synthetase function, providing potentially useful information for structure-based inhibitor design.

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
苏氨酸	苏氨酸——tRNA连接酶,胞质	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节