Immunoaffinity浓缩蛋白质甲基化和质谱分析。

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周顾郭,H, J, Mulhern D,王Y, Lee KA,杨V, Aguiar M, Kornhauser J,贾X,任J, Beausoleil SA,席尔瓦JC Vemulapalli V,贝德福德太,梳子乔丹

Immunoaffinity浓缩蛋白质甲基化和质谱分析。

摩尔细胞蛋白质组学。2014年1月,13 (1):372 - 87。doi: 10.1074 / mcp.O113.027870。Epub 2013年10月15日。

PubMed ID

24129315 (在PubMed

]

文摘

蛋白甲基化是一种常见的转译后的修改,主要发生在精氨酸和赖氨酸残基。精氨酸甲基化调节RNA加工,基因转录、DNA损伤修复、蛋白质运输和信号转导。赖氨酸甲基化而闻名调节组蛋白功能和参与表观遗传基因转录的调控。为了更好地研究蛋白质甲基化,我们已经开发出高度特定的抗体单甲精氨酸;不对称二甲基精氨酸;单甲,二甲基三甲基赖氨酸图案。这些抗体被用来执行immunoaffinity净化甲基肽质/ MS分析识别和量化研究精氨酸和赖氨酸甲基化网站在几个模型。总的来说,我们发现超过1000个精氨酸甲基化网站在人类细胞系和鼠标组织,和大约160人类细胞系HCT116赖氨酸甲基化的网站。甲基化网站的数量确定在本研究中超过迄今文献中发现的。详细分析arginine-methylated蛋白质中观察到小鼠大脑与小鼠胚胎中发现显示了一个组织的精氨酸甲基化分布,和扩展的类型已知的蛋白质精氨酸甲基化包括许多新的蛋白质类型。 Many arginine-methylated proteins that we identified from the brain, including receptors, ion channels, transporters, and vesicle proteins, are involved in synaptic transmission, whereas the most abundant methylated proteins identified from mouse embryo are transcriptional regulators and RNA processing proteins.

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多肽

的名字	UniProt ID
Calmodulin-2	P0DP24	细节
Calmodulin-3	P0DP25	细节
异构核核糖核蛋白A2 / B1	P22626	细节
异构核核糖核蛋白H	P31943	细节
异构核核糖核蛋白H3	P31942	细节
剪接因子,脯氨酸和多	P23246	细节
蛋白质disulfide-isomerase A3	P30101	细节
异构核核糖核蛋白K	P61978	细节
70 kDa热休克蛋白4	P34932	细节
瑞士/ SNF-related矩阵actin-dependent调节器的染色质亚科1 E成员	Q969G3	细节
目前上游元件结合蛋白2	Q92945	细节
异构核核糖核蛋白D0	Q14103	细节
40年代S19核糖体蛋白质	P39019	细节
剪接因子1	Q15637	细节
Transgelin-2	P37802	细节
Zyxin	Q15942	细节
丝氨酸/ arginine-rich剪接因子1	Q07955	细节
Transgelin	Q01995	细节
增殖蛋白激酶15	Q8TD08	细节
Misshapen-like激酶1	Q8N4C8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Nek4	P51957	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PAK 4	O96013	细节
电压门控钾离子通道亚基beta 2	Q13303	细节
ELAV-like蛋白1	Q15717	细节
双特异性增殖蛋白激酶激酶4	P45985	细节
硫氧还蛋白还原酶3	Q99MD6	细节