剪接因子，富含脯氨酸和谷氨酰胺

细节

名字
剪接因子，富含脯氨酸和谷氨酰胺
同义词
  • 100 kDa dna配对蛋白
  • dna结合p52/p100复合物，100 kDa亚基
  • hPOMp100
  • 聚嘧啶束结合蛋白相关剪接因子
  • PSF
  • PTB-associated-splicing因素
基因名字
SFPQ
生物
人类
氨基酸序列
>拼箱| BSEQ0049646 |剪接因子,脯氨酸和多MSRDRFRSRGGGGGGFHRRGGGGGRGGLHDFRSPPPGMGLNQNRGPMGPGPGQSGPKPPI PPPPPHQQQQQPPPQQPPPQQPPPHQPPPHPQPHQQQQPPPPPQDSSKPVVAQGPGPAPG VGSAPPASSSAPPATPPTSGAPPGSGPGPTPTPPPAVTSAPPGAPPPTPPSSGVPTTPPQ AGGPPPPPAAVPGPGPGPKQGPGPGGPKGGKMPGGPKPGGGPGLSTPGGHPKPPHRGGGE PRGGRQHHPPYHQQHHQGPPPGGPGGRSEEKISDSEGFKANLSLLRRPGEKTYTQRCRLF VGNLPADITEDEFKRLFAKYGEPGEVFINKGKGFGFIKLESRALAEIAKAELDDTPMRGR QLRVRFATHAAALSVRNLSPYVSNELLEEAFSQFGPIERAVVIVDDRGRSTGKGIVEFASKPAARKAFERCSEGVFLLTTTPRPVIVEPLEQLDDEDGLPEKLAQKNPMYQKERETPPRF AQHGTFEYEYSQRWKSLDEMEKQQREQVEKNMKDAKDKLESEMEDAYHEHQANLLRQDLM RRQEELRRMEELHNQEMQKRKEMQLRQEEERRRREEEMMIRQREMEEQMRRQREESYSRM GYMDPRERDMRMGGGGAMNMGDPYGSGGQKFPPLGGGGGIGYEANPGVPPATMSGSMMGS DMRTERFGQGGAGPVGGQGPRGMGPGTPAGYGRGREEYEGPNKKPRF
残数
707
分子量
76149.15
理论π
不可用
去分类
功能
染色质绑定/核心启动子结合/DNA结合/组蛋白去乙酰化酶结合/蛋白同型二聚化活性/核糖核酸绑定/RNA聚合酶II远端增强子序列特异性DNA结合/转录调控区DNA结合/转录调控区序列特异性DNA结合
流程
可选择的mRNA剪接，通过剪接体/同源重组修复双链断裂/组蛋白H3去乙酰化/信使rna加工/昼夜节律负调节/RNA聚合酶II启动子转录负调控/转录负调控，dna模板化/氧化应激诱导的细胞凋亡信号通路的正向调节/姐妹染色单体内聚的正调控/RNA聚合酶II启动子的转录正调控/昼夜节律调节/有节奏的过程/RNA拼接/转录,dna模板
组件
染色质/细胞质/细胞外基质/核矩阵/核斑点/核浆/核/paraspeckles/RNA聚合酶II转录因子复合物
通用函数
DNA和RNA结合蛋白，参与多种核过程。必要的pre-mRNA剪接因子在剪接体形成的早期和剪接催化步骤II中需要，可能作为NONO的异聚体。结合剪接体C复合体的前mrna，并特异性结合内含子多嘧啶束。参与信号诱导的选择性剪接的调控。在PTPRC/CD45剪接过程中，在静止的t细胞中，THRAP3从前mrna中分离出磷酸化形式;t细胞活化和随后的磷酸化降低被认为会导致THRAP3的释放，从而允许与抑制外显子包含的pre-mRNA剪接调节元件结合。与U5 snRNA相互作用，可能通过结合位于U5 snRNA干1b 3'侧的富含嘌呤的序列。作为SNRPA/U1A无snrnp复合物的组成部分，可能参与mrna前偶联剪接和聚腺苷化过程。与MATR3相关的SFPQ-NONO异构体可能在缺陷rna的核保留中起作用。SFPQ可能参与同源DNA配对; in vitro, promotes the invasion of ssDNA between a duplex DNA and produces a D-loop formation. The SFPQ-NONO heteromer may be involved in DNA unwinding by modulating the function of topoisomerase I/TOP1; in vitro, stimulates dissociation of TOP1 from DNA after cleavage and enhances its jumping between separate DNA helices. The SFPQ-NONO heteromer binds DNA (PubMed:25765647). The SFPQ-NONO heteromer may be involved in DNA non-homologous end joining (NHEJ) required for double-strand break repair and V(D)J recombination and may stabilize paired DNA ends; in vitro, the complex strongly stimulates DNA end joining, binds directly to the DNA substrates and cooperates with the Ku70/G22P1-Ku80/XRCC5 (Ku) dimer to establish a functional preligation complex. SFPQ is involved in transcriptional regulation. Functions as transcriptional activator (PubMed:25765647). Transcriptional repression is mediated by an interaction of SFPQ with SIN3A and subsequent recruitment of histone deacetylases (HDACs). The SFPQ-NONO-NR5A1 complex binds to the CYP17 promoter and regulates basal and cAMP-dependent transcriptional avtivity. SFPQ isoform Long binds to the DNA binding domains (DBD) of nuclear hormone receptors, like RXRA and probably THRA, and acts as transcriptional corepressor in absence of hormone ligands. Binds the DNA sequence 5'-CTGAGTC-3' in the insulin-like growth factor response element (IGFRE) and inhibits IGF-I-stimulated transcriptional activity. Regulates the circadian clock by repressing the transcriptional activator activity of the CLOCK-ARNTL/BMAL1 heterodimer. Required for the transcriptional repression of circadian target genes, such as PER1, mediated by the large PER complex through histone deacetylation (By similarity). Required for the assembly of nuclear speckles (PubMed:25765647).
特定的功能
染色质绑定
Pfam域函数
跨膜区
不可用
细胞的位置
核散斑
基因序列
>拼箱| BSEQ0049647 |剪接因子,脯氨酸和多(SFPQ) ATGTCTCGGGATCGGTTCCGGAGTCGTGGCGGTGGCGGTGGTGGCTTCCACAGGCGTGGA GGAGGCGGCGGCCGCGGCGGCCTCCACGACTTCCGTTCTCCGCCGCCCGGCATGGGCCTC AATCAGAATCGCGGCCCCATGGGTCCTGGCCCGGGCCAGAGCGGCCCTAAGCCTCCGATC CCGCCACCGCCTCCACACCAACAGCAGCAACAGCCACCACCGCAGCAGCCACCGCCGCAG CAGCCGCCACCGCATCAGCCGCCGCCGCATCCACAGCCGCATCAGCAGCAGCAGCCGCCG CCACCGCCGCAGGACTCTTCCAAGCCCGTCGTTGCTCAGGGACCCGGCCCCGCTCCCGGA GTAGGCAGCGCACCACCAGCCTCCAGCTCGGCCCCGCCCGCCACTCCACCAACCTCGGGGGCCCCGCCAGGGTCCGGGCCAGGCCCGACTCCGACCCCGCCGCCTGCAGTCACCTCGGCC CCTCCCGGGGCGCCGCCACCCACCCCGCCAAGCAGCGGGGTCCCTACCACACCTCCTCAG GCCGGAGGCCCGCCGCCTCCGCCCGCGGCAGTCCCGGGCCCGGGTCCAGGGCCTAAGCAG GGCCCAGGTCCGGGTGGTCCCAAAGGCGGCAAAATGCCTGGCGGGCCGAAGCCAGGTGGC GGCCCGGGCCTAAGTACGCCTGGCGGCCACCCCAAGCCGCCGCATCGAGGCGGCGGGGAG CCCCGCGGGGGCCGCCAGCACCACCCGCCCTACCACCAGCAGCATCACCAGGGGCCCCCG CCCGGCGGGCCCGGCGGCCGCAGCGAGGAGAAGATCTCGGACTCGGAGGGGTTTAAAGCC AATTTGTCTCTCTTGAGGAGGCCTGGAGAGAAAACTTACACACAGCGATGTCGGTTGTTTGTTGGGAATCTACCTGCTGATATCACGGAGGATGAATTCAAAAGACTATTTGCTAAATAT GGAGAACCAGGAGAAGTTTTTATCAACAAAGGCAAAGGATTCGGATTTATTAAGCTTGAA TCTAGAGCTTTGGCTGAAATTGCCAAAGCCGAACTGGATGATACACCCATGAGAGGTAGA CAGCTTCGAGTTCGCTTTGCCACACATGCTGCTGCCCTTTCTGTTCGTAATCTTTCACCT TATGTTTCCAATGAACTGTTGGAAGAAGCCTTTAGCCAATTTGGTCCTATTGAAAGGGCT GTTGTAATAGTGGATGATCGTGGAAGATCTACAGGGAAAGGCATTGTTGAATTTGCTTCT AAGCCAGCAGCAAGAAAGGCATTTGAACGATGCAGTGAAGGTGTTTTCTTACTGACGACA ACTCCTCGTCCAGTCATTGTGGAACCACTTGAACAACTAGATGATGAAGATGGTCTTCCTGAAAAACTTGCCCAGAAGAATCCAATGTATCAAAAGGAGAGAGAAACCCCTCCTCGTTTT GCCCAGCATGGCACGTTTGAGTACGAATATTCTCAGCGATGGAAGTCTTTGGATGAAATG GAAAAACAGCAAAGGGAACAAGTTGAAAAAAACATGAAAGATGCAAAAGACAAATTGGAA AGTGAAATGGAAGATGCCTATCATGAACATCAGGCAAATCTTTTGCGCCAAGATCTGATG AGACGACAGGAAGAATTAAGACGCATGGAAGAACTTCACAATCAAGAAATGCAGAAACGT AAAGAAATGCAATTGAGGCAAGAGGAGGAACGACGTAGAAGAGAGGAAGAGATGATGATT CGTCAACGTGAGATGGAAGAACAAATGAGGCGCCAAAGAGAGGAAAGTTACAGCCGAATG GGCTACATGGATCCACGGGAAAGAGACATGCGAATGGGTGGCGGAGGAGCAATGAACATGggagatccatccagagagatatccagagagatccagagagatccagagagatccagagagatccagagagatccagagatccagagatccagagatccagagatccagagatccagagatccagagagatccaacaaaaaaccccgatattag ggagagagagatccaacaaaaaaccccgattttag
染色体的位置
1
轨迹
1 p34.3
外部标识符
资源 链接
UniProtKB ID P23246
UniProtKB表项名称 SFPQ_HUMAN
HGNC ID HGNC: 10774
一般引用
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